一、一般規定
傳染病醫院室內溫度要求，對于醫療設備用房首先應保證醫療設備正常工作同時兼顧人員舒適要求，而對于病房、治療室等則應滿足病人治療及舒適要求。
新建醫院應該設置集中采暖，采暖設計溫度應保證舒適度。目前采暖的方式多種多樣，并不是都適用于傳染病醫院建筑。如低溫熱水地板采暖、發熱電纜地板采暖、電熱膜采暖等方式，他們的舒適性并不一定適用于傳染病醫院，有的也不利于控制空氣污染。所以規范中建議采用散熱器采暖。
1、嚴格控制氣流流線-院感的硬性要求
為了控制整個傳染病醫院或綜合醫院的傳染病區的空氣流向，防止污染空氣擴散減小傳染范圍，要求傳染病醫院或綜合醫院的傳染病區應設置機械通風系統。控制氣流流向是防止空氣交叉污染的根本故設為強制性條文，必須嚴格執行。
2、排風系統、送風系統獨立設置
醫院分清潔區、半污染區、污染區，各區空氣污染程度不同，為防止污染區域的空氣通過通風管道對較清潔區域空氣的影響，要求送風、排風系統分區設置，杜絕污染空氣通過系統流到清潔區的可能本條為強制性條文，必須嚴格執行。
3、門診區通風系統獨立設置
根據建筑平面設置，醫院門診、總診部入口處設有接診或篩查，對不同傳染病患者進行分流。為有效控制傳染病的擴散，要求此區域通風系統獨立設置。
4、氣流流向原則
傳染病醫院或綜合醫院的傳染病區應特別注意建筑物內的氣流流向，即應嚴格保證醫院的壓力梯度，使清潔區空氣流向半污染區再流向污染區，絕不允許氣流倒流。全面通風系統經設計和平衡應該使空氣從較少污染的區域（較為潔凈區域) 流向較多污染區域（較不潔凈區域)。例如，空氣流向應從走廊流入病房，以防止污染物傳播到其他區域。本條強調排風口應該遠離進風口并避開人員活動區，防止進、排風口設置過近。具體可參照現行國家標準《采暖通風與空氣調節設計規范》GB 50019第5.3.4節執行。傳統的衛生間排風系統大多數采用共用豎井排出屋面。但在傳染病醫院，其科室一般都是分層分布的，呼吸道傳染病房的衛生間的排風有可能通過共用豎井流入別的層的病房衛生間，造成交叉污染。應分病區設置排風系統。傳染病醫院里攜帶各種病原體的病人來回穿梭，風幕吹出的高速空氣加快了空氣中細菌、病毒的擴散，因此不宜設置空氣幕。
5、中央空調系統在不同分區的設置
經濟條件比較好、氣候條件比較惡劣的地區，當設計中央空調系統時，它的新風系統就是前面說到的送風系統，排風系統同樣設置在此基礎上，當某一個或數個小空間的空氣被病菌污染，它被控制在小范圍內。如果采用全空氣系統 (CAV或VAV)它的回風會造成各房間之間的交叉污染，如果都用全新風系統，那么空調系統的投資及運行費用會成倍上升。大空間(中庭、門診大廳等)建議設置全空氣系統，并按全新風空調系統設計。這些區域人員較雜，防止回風造成大范圍污染。
醫院一直以全新風空調系統運行，這會大大增加醫院的運行費用，在一年中的非呼吸道傳染病流行期間，如果把系統能夠調節成有部分回風運行空調系統，會節省醫院的運行費用。當然，這需要流行病研究人員、醫務人員及維護管理人員掌握各季流行病的情況，及時調節空調系統運行狀況。手術室、重癥監護室(ICU) 以及醫療設備用房，因其空間比較封閉，溫濕度有一定的要求，一般應該設置空調系統，來滿足重癥病人的舒適度要求或醫療設備的運行條件要求。有空調要求的醫療設備，它的負壓要求通過設計合理的送、排風系統來實現。在此基礎上，設置獨立的空調機組(或恒溫恒濕機組)來滿足醫療設備的溫度、濕度要求。獨立的空調機組的冷熱量應考慮通風系統帶入的負荷。
6、冷凝水管的安裝
一般公共建筑的空調冷凝水，有時會直接排放至房間地漏或室外散水等處。附著在漂浮在空氣中的灰塵穎粒上的病菌會在空調機換熱盤管上，并隨冷凝水排出。這些在冷凝水中的病菌有可能使人員致病。所以應該避免將空調冷凝水排到裸露的地面而應該將冷凝水排到設置的冷凝水管，引至醫院的廢、污水系統，集中處理。
二、非呼吸道傳染病區
對于非呼吸道傳染病，主要考慮人員舒適和氣味控制的新風量，建議最小換氣次數3次/h。在冬季較溫暖、夏季涼爽地區， 換氣次數可增加。非呼吸道傳染病區也需要通過風量差來控制污染區氣味等。
三、呼吸道傳染病區
對呼吸道傳染病，理論上講房間通風量越大，對空氣中細菌、病毒的稀釋越好。但我國地域遼闊，氣候條件多樣，在設置采暖和空調的建筑內，較大的通風量代表著較大的能耗。有效的空氣稀釋控制需要每小時多少換氣次數，在這方面有很多爭論。AL和ASHRAE建議肺結核病隔離病房和治療室的最小換氣次數為6次，大于6次的換氣次數可能使房間的細菌濃度更低，但增加通風量而使傳染的風險降低的準確數據還沒有。在冬季較溫暖、夏季涼爽地區，上述的6次/h的換氣次數可考慮加大。空氣的氣流組織應排除死區、停滯和送排風短路，防止細菌、病毒的積聚。氣流組織的要求，使得醫務人員不會處于傳染源和排風口之間，減小醫務人員被感染的機會。實現所述氣流組織的一種方式是送風在房間的一側與病人相對，排風從病人的一側將空氣排出：另一種方式在送風溫度比室內空氣溫度低時是Z有效的，這種方式下，送風在天花板附近，而排風在地板附近。ASHRAE也推薦高處送風、低處排風，即送風口應安裝在天花板，排風口安裝在地板附近，這就使潔凈空氣通過呼吸區和工作區向下流動到污染的地板區域排出。
1、負壓0.25Pa為最小壓差
實現并維持負壓、使氣流流入房間所必需的最小壓差非常小(約0.25Pa)。大于這個壓差都符合要求，但較大的壓差可能難于實現，使用時獲得的實際負壓大小取決于送風、排風量差和房間圍護結構的密閉程度，如果房間密封得好，負壓大于最小值0.25Pa容易實現，如果房間密封不好，為了獲得較高的負壓，所需的送風、排風量差可能會超過通風系統設計的能力。排風量大于送風量的大多數情況下，應該實現至少0.25Pa的負壓。如果最小負壓值沒有實現，應該檢查房間的泄漏情況(如通過門、窗、 穿越的管道縫隙及墻體的泄漏)，并應該采取措施來封堵。根據國內有關單位實測150m3的風量差是為了保證最小壓差下流過門縫的空氣Z低的要求(國外推薦值85m3)。同一個通風系統，也要防止不同房間的空氣交叉污染。當通風系統因各種原因停止運行時，風管是連通各個房間的直接通道，由于風壓、熱壓等作用有可能病房之間的空氣會相互流動。同時，當個別房間需要消毒時，要求單獨密閉。所以要求在支風管設置電動密閉閥以防止各房間空氣互相交叉污染，并可單獨關斷，進行消毒。
2、負壓隔離病房
當設置傳染性負壓隔離病房時，因它的建筑圍護結構密閉， 它的氣流都是在精確控制下，不允許有自然通風的可能。要創造一個舒適的環境，就必須設置空調系統。鑒于這類病房要控制的是空氣中致命性的病原體，目前空調機對回風的空氣處理不能保證100%阻隔或殺死病菌，所以要求采用全新風直流式空調系統。參照美國CDC規范，傳染性(負壓)隔離病房最小需要2次換氣，這也是密閉房間空調系統達到舒適的溫濕度應該達到的風量，所以建議用此通風量。
3、過濾器的設置
負壓隔離病房的病人一般體質較弱，內部散發的污染物主要為致病病原體。空調送風設置粗、中、亞高效過濾器三級過濾， 送入潔凈的空氣，一是為防止帶入其他致病病菌，影響病人；二是防止大量灰塵進入，給內部的致病病原體帶來寄生體或攜帶體。由于送入的是潔凈的空氣，在12次/h風量下，隔離病房內是凈化的環境，排風只需設置高效過濾，阻隔病房內產生的灰塵和病菌，我國的潔凈專家經過實驗證明，高效過濾器可阻隔絕大部分的灰塵及其附著的病菌。為了防止負壓隔離病房之間的帶菌空氣互相污染，要求負壓隔離病房排風的高效過濾器安裝在房間排風口部，也便于更換、消毒。
4、送風排風管設密閉閥
每間負壓隔離病房因所住病人情況不同，有的病愈出院，有的病情惡化，會有bing房騰空消毒，而其他病房的空調還不能停止，故要求每間隔離病房的送、排風管設置密閉閥，以便單獨隔斷每間病房。
5、建議采用定風量裝置
隨著空氣過濾器積塵，阻力增加，系統風量會減小，其壓力梯度會有所變化，在系統設計中應考慮這個因素。為避免空氣過濾器積塵對系統風量的影響，系統定風量運行可以保證穩定的壓力梯度，所以建議采用定風量裝置。
6、壓差檢測和報警裝置要設置
過濾器的壓差檢測及報警裝置，使運行維護人員可以及時更換過濾器，保證系統正常運行。
7、壓差計要設置在便于觀察的位置
負壓隔離病房門口或便于觀察處應設置房間壓差檢測和顯示裝置，能夠讓使用者隨時了解病房壓力情況，掌握病區壓力梯度保障情況。