層流手術室是采用空氣潔凈技術對微生物污染采取程度不同的控制，達到控制空間環境中空氣潔凈度適于各類手術之要求；并提供適宜的溫、濕度，創造一個潔凈舒適的手術空間環境。由于潔凈手術室要嚴格控制低細菌數及低麻醉氣體濃度，所以層流超凈裝置的穩定性是層流凈化手術室的重要驗收指標。由于歐美手術室潔凈標準與中國環境存在細微差別，常規的標準和國內區域行業標準都普遍難于確保手術室凈化的長期穩定(一般只能3-10年重建、低檔工程1年即需要翻新)，所以在工程質量方面出現了明顯的檔次劃分。一些凈化工程公司，在通行標準之外，基本都設有自身執行的高于化通行標準的凈化指標。
一、層流潔凈手術室的設計和設備要求
(一)手術室的設計
坐南朝北，位于建筑的較高處，以保持空氣潔凈、防止院內感染為原則，地面、墻壁可以沖洗。要三區劃分合理：即有非限制區、半限制區、限制區。要有三通道：即工作人員通道、病人出入通道、污物出口通道。材料應防火、耐濕、不易著色，以具有易于清潔等性能的材料為宜。現代化手術室應設計有：空氣凈化裝置、中心供氧、中心吸引等裝置。
(二)手術室的設備
除了具備一般手術室常規器械外，應有閉路電視、空調、電刀(進口)，為保證不因意外停電影響手術，醫院應備有發電設施。不使手術室地面污染，使用交換車等現代推車。
二、手術室人員編制及醫院手術床位
手術室護士與手術床之比應為：2.5:1，教學醫院3：1。手術床設置為：以手術科50張床位設1臺手術床為宜，衛生員0.5:1為妥。設護士長1～2人。
三、層流手術室的規章制度
手術室是手術科醫師、麻醉師及手術室人員共同工作的場所，人員流動量大，為保證工作有序，不但各項操作有規程，而且有一定的工作制度，才能使各科手術順利完成。
1、凡進入手術室的工作人員，必須穿戴手術室的鞋帽、衣服及口罩，離開手術室時，應更換外出衣及鞋子。
2、院外來參觀、學習、實習者，須經醫教科或護理部批準，并應有固定地點。
3、各科擇期手術，應在手術前一日上午10點半以前送手術通知單，急診搶救手術，可先口頭通知，后補手術通知單。
4、手術按手術通知單時間進行，必須準時到位，不得隨意更改。特殊情況與護士。
5、術前30分鐘接病人，隨帶病歷，并詳細核對病人姓名、性別、年齡、床號、診斷、手術部位及藥敏試驗、術前用藥。病員入室后，巡回護士應復查一遍，注意病人手術部位清潔范圍，首飾、假牙、手表不得帶入手術室。
6、嚴格無菌操作技術。無菌手術和有菌手術應分室進行，特殊感染須進行特殊消毒滅菌處理。
7、室內保持嚴肅安靜，禁止高聲喧嘩，手術期間不得聊天、看報等。
8、嚴格執行室內衛生清潔處理及隔離、消毒檢測制度，落實醫療安全防范措施。
9、手術室應常備各種急診手術包及搶救器材，手術器械不得外借，如外借的需醫教科批準。
10、手術室器械應在清潔干凈基礎上消毒，各種藥品器械材料應放在固定位置，貴重器械專人保管，每月清點、維修、保養。普通藥品每天清點并記錄，每月檢查一次，專人負責。
11、負責保管和送檢手術中采集的標本，請醫生及時填寫病理標本、送檢單并作好送檢登記，督促及時送檢。
合理的設計，良好的硬件設施和嚴謹的規章制度是潔凈層流手術室運作的必要保證，只有這樣醫院手術室的凈化工程才能得以持續運轉，取得更好的效果。