1、潔凈室的自凈時間檢測通常只適用于非單向流潔凈室，一般以大氣塵或煙霧發生器等人工塵源為基準，采用粒子計數器測試。
2、首先應測量潔凈室內靠近回風口處穩定的含塵濃度（N）。
如果以大氣塵為基準，則必須將潔凈室停止運行相當時間，在室內含塵濃度已接近于大氣濃度時，測出潔凈室內靠近回風口處的含塵濃度（N₀）。然后開機，定時讀數（一般可設置每間隔6s讀數一次），直到回風口處的含塵濃度回復到原來的穩定狀態，記錄下所需的時間（t）。
以人工塵源為基準時，應將煙霧發生器（如巴蘭香煙）放置在地面上1.8m以上室中心，發煙1~2min后停止，等待1min測出潔凈室內靠近回風口處的含塵濃度（N₀）。然后開機，方法同上。
3、由初始濃度（N₀），室內達到穩定的濃度（N），實際換氣次數（n），可得到計算自凈時間（t₀），與實測自凈時間（t）進行對比，一般的，如果t≤1.2t₀,為合格。
4、潔凈室的自凈性能還可以采用粒子濃度變化率評估，或者直接測量潔凈室的100:1-自凈時間進行評估，具體方法可參照ISO14644-3中的B.13。