1、檢測程序
潔凈室的檢測主要是指對潔凈室或潔凈區域的空氣潔凈度等級進行測定，生物潔凈室還要進行浮游菌、沉降菌的測試。在工程建設過程中的檢測主要包括竣工驗收和潔凈室綜合性能評定兩個階段的檢測。在潔凈廠房使用過程中，應對潔凈室或潔凈區域進行監測，并定期進行綜合性能測試，以認證該潔凈室或潔凈區域是否始終符合要求。
（1）潔凈室的檢測首先應明確潔凈室或潔凈區城的占用狀態，按照GB 50073 -2013 《潔廠房設計規范》 規定，潔凈室檢測狀態分為空態、 靜態和動態三種：
a.空態檢測。設施已建成，其服務動力共用設施區接通并運行，但在無生產設備、材料和人員的狀態下所進行的測試稱為空態檢測。
b.靜態檢測。設施已建成，生產設備已經安裝好，并按供需雙方商定的狀態運行，但無生產人員的狀態下所進行的測試稱為靜態檢測。
c.動態檢測。設施以規定的方式運行，并在商定的狀態下進行工作，在此情況下進行的測試稱為動態檢測。
（2）潔凈室的檢測可分為潔凈室工程竣工驗收的檢測、綜合性能評定的檢測和運行中的監及定期綜合性能檢測，目的是認證該潔凈室(區)是否始終符合設計要求，確保工廠的生產環境滿足產品質量需求，達到穩定的產品質量、成品率，創造較好的經濟效益。
（3）建設單位關心運行狀態下的潔凈室空氣潔凈度等級，即生產設備運轉及操作人員在場的工作狀態時的測試結果，即動態的測試結果。而施工者通常希望在空態下測試的結果作為工程竣工驗收結果。
我國CB 50591-2010 《潔凈室施工及驗收規范》中明確規定，工程竣工驗收及綜合性能全面評定主要由建設單位負責，設計和施工單位配合，且竣工驗收的檢測和調整應在空態下進行，綜合性能全面評定的檢測狀態應由建設單位、設計單位和施工單位三方協商確定。主要原因是潔凈室動態測試一般超出了潔凈室施工單位的控制范圍，而且以空態或靜態作為檢測狀態的規定更能及時客觀地評價工程的質量。
2、檢測內容
（1）竣工驗收
GB50591-2010《潔凈室施工及驗收規范》中明確規定：竣工驗收在對各分部工程作外觀檢查、單機試轉運、系統聯合試運轉，空態或靜態條件下的潔凈室性能檢測和調整以及對有關的施工檢查記錄合格后進行。
（2）綜合性能全面評定
綜合性能全面評定的檢測工作必須由有經驗的第三方承擔，而且所用儀表必須合格有效。檢測工作須在系統調整符合設計要求并運行至少24h后進行，而且在檢測之前，必須對潔凈室及凈化空調系統再次進行全面*的清掃。
（3）潔凈室（區）性能測試和認證
潔凈室（區）投入運行后，為了檢測其綜合性能是否可以始終符合設計要求，標準規范的規定和滿足業主的產品生產質量要求，需對潔凈室（區）進行監測和定期性能測試認證，測試認證工作應由專門的潔凈室檢測認證單位承擔。